Amidaza (AMD)
Enzymy:Są to makrocząsteczkowe katalizatory biologiczne, większość enzymów to białka
Amidaza:Katalizują hydrolizę różnych endogennych i obcych amidów alifatycznych i aromatycznych poprzez przeniesienie grupy acylowej do wody, z wytworzeniem wolnych kwasów i amoniaku. Kwasy hydroksamowe i inne kwasy organiczne są szeroko stosowane jako leki, ponieważ są składnikami czynników wzrostu, antybiotyków i inhibitorów nowotworów. Amidazy można podzielić na acylazy typu R i typu S w zależności od stereoselektywności katalizatora.
Oprócz katalizowania hydrolizy amidów amidaza może również katalizować reakcje przenoszenia acylu w obecności współsubstratów, takich jak hydroksyloamina.
Amidazy z różnych źródeł charakteryzują się różną specyficznością substratową. Niektóre z nich hydrolizują tylko amidy aromatyczne, inne hydrolizują tylko amidy alifatyczne, a jeszcze inne hydrolizują amidy α- lub ω-amino. Większość amin wykazuje dobrą aktywność katalityczną jedynie w przypadku amidów acyklicznych lub prostych amidów aromatycznych, natomiast w przypadku złożonych związków aromatycznych amidy heterocykliczne, zwłaszcza amidy z podstawnikami orto, charakteryzują się zazwyczaj niską aktywnością (tylko kilka enzymów wykazuje lepsze właściwości katalityczne).
Mechanizm katalityczny:
| Enzymy | Kod produktu | Kod produktu |
| Proszek enzymatyczny | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | zestaw 19 amidaz po 50 mg każda 19 szt. * 50 mg / szt. lub inna ilość |
| Zestaw do badań przesiewowych (SynKit) | ES-AMD-1900 | zestaw 19 amidaz po 1 mg każda 19 sztuk * 1 mg / sztuka |
★ Wysoka specyficzność substratowa.
★ Silna selektywność chiralna.
★ Wysoka wydajność konwersji.
★ Mniej produktów ubocznych.
★ Łagodne warunki reakcji.
★ Przyjazne dla środowiska.
➢ Badanie enzymów należy przeprowadzić pod kątem specyficznych substratów ze względu na ich specyficzność, aby uzyskać enzym, który katalizuje docelowy substrat z najlepszym efektem katalitycznym.
➢ Nigdy nie narażaj się na kontakt z ekstremalnymi warunkami, takimi jak: wysoka temperatura, wysokie/niskie pH i rozpuszczalniki organiczne o wysokim stężeniu.
➢ Zazwyczaj układ reakcji powinien zawierać substrat i roztwór buforowy (optymalne pH reakcji enzymu). W układzie reakcji transferu acylu powinny być obecne kosubstraty, takie jak hydroksyloamina.
➢ AMD należy dodać do układu reakcyjnego na końcu, przy zachowaniu optymalnego pH i temperatury reakcji.
➢ Każdy rodzaj AMD ma różne optymalne warunki reakcji, dlatego każdy z nich powinien być badany indywidualnie.
Przykład 1(1):
Aktywność hydrolizy do różnych substratów amidowych
| Podłoże | Konkretna aktywność μmol min-1mg-1 | Podłoże | Konkretna aktywność μmol min-1mg-1 |
| Acetamid | 3.8 | ο-OH benzamid | 1.4 |
| Propionamid | 3.9 | p-OH benzamid | 1.2 |
| Laktamid | 12.8 | ο-NH2benzamid | 1.0 |
| Butyramid | 11.9 | p-NH2benzamid | 0,8 |
| Izobutyramid | 26.2 | ο-Toluamid | 0,3 |
| Pentanamid | 22,0 | p-Toluamid | 8.1 |
| Heksanamid | 6.4 | Nikotynamid | 1.7 |
| Cykloheksanamid | 19,5 | Izonikotynamid | 1.8 |
| Akrylamid | 10.2 | Pikolinamid | 2.1 |
| Metakrylamid | 3.5 | 3-fenylopropionamid | 7.6 |
| Prolinamid | 3.4 | Indol-3-acetamid | 1.9 |
| Benzamid | 6.8 |
Reakcję przeprowadzono w 50 mM buforze fosforanu sodu, pH 7,5, w temperaturze 70 ℃.
| Amidy | Hydroksylamina | Hydrazyna |
| Acetamid | 8.4 | 1.4 |
| Propionamid | 18.4 | 3.0 |
| Izobutyramid | 25,0 | 22.7 |
| Benzamid | 9.2 | 6.1 |
Reakcję przeprowadzono w 50 mM buforze fosforanu sodu, pH 7,5, w temperaturze 70 ℃.
Stężenie odczynników powiązanych: amidy 100 mM (benzamid 10 mM); hydroksyloamina i hydrazyna 400 mM; enzym 0,9 μM.
Przykład 2(2):
Przykład 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S. i in. Ekstremofile, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR i in. Biochemia procesów, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM i in. Chemia bioorganiczna, 2017, Dostępne online 7.
